Το σήμα πολυαδενυλίωσης - το μοτίβο αλληλουχίας που αναγνωρίζεται από το σύμπλεγμα διάσπασης RNA - ποικίλλει μεταξύ των ομάδων ευκαρυωτών. … Η θέση διάσπασης που σχετίζεται με ένα σήμα πολυαδενυλίωσης μπορεί να ποικίλλει έως και περίπου 50 νουκλεοτίδια. Όταν το RNA διασπάται, ξεκινά η πολυαδενυλίωση, η οποία καταλύεται από την πολυαδενυλική πολυμεράση.
Ποιος είναι ο σκοπός του σήματος πολυαδενυλίωσης;
Ο σκοπός και ο μηχανισμός της πολυαδενυλίωσης ποικίλλουν μεταξύ των τύπων κυττάρων, αλλά η πολυαδενυλίωση γενικά χρησιμεύει για την προαγωγή της μακροζωίας μεταγραφής στους ευκαρυώτες και την υποβάθμιση του μεταγραφήματος στους προκαρυώτες.
Πού βρίσκεται η αλληλουχία σήματος πολυαδενυλίωσης;
Η διάσπαση
mRNA στα θηλαστικά πιστεύεται ότι ελέγχεται από δύο σήματα κυρίαρχης αλληλουχίας, το καλά καθορισμένο σήμα πολυαδενυλίωσης (PAS) που βρίσκεται 10-30 βάσεις ανάντη της θέσης διάσπασης mRNA (CS)και μια λιγότερο διατηρημένη αλληλουχία πλούσια σε U, που ονομάζεται downstream sequence element (DSE) και βρίσκεται εντός των πρώτων 30 νουκλεοτιδίων …
Πού εντοπίζεται συχνότερα η αλληλουχία σήματος πολυαδενυλίωσης στο γονίδιο;
Στο σύστημα των θηλαστικών, η αποτελεσματική πολυαδενυλίωση απαιτεί δύο κύρια συστατικά αλληλουχίας: ένα εξαιρετικά διατηρημένο σήμα AAUAAA που βρίσκεται 10-30 νουκλεοτίδιο 5′ στη θέση διάσπασης και ένα πιο μεταβλητό GU- πλούσιο στοιχείο, 20-40 βάσεις 3′ της τοποθεσίας (βλ. Proudfoot 1991· Colgan and Manley 1997 για κριτικές).
Ποιο είναι το πιο κοινόσυναινετική αλληλουχία για πολυαδενυλίωση;
Σχεδόν όλα τα σήματα ευκαρυωτικής πολυαδενυλίωσης περιέχουν ένα στοιχείο πυρήνα ανάντη, την συναινετική αλληλουχία AAUAAA (ή μια παραλλαγή) ~10-35 νουκλεοτίδια ανάντη της πραγματικής θέσης προσθήκης πολυ(Α)(κριτική στα 6-7, 12).