Οι αναστολείς πρωτεάσης σερίνης, ή οι σερπίνες, περιλαμβάνουν μια οικογένεια πρωτεϊνών που ανταγωνίζονται τη δραστηριότητα των πρωτεασών της σερίνης. Αυτές οι πρωτεΐνες αναστέλλουν τη δραστηριότητα πρωτεάσης μέσω ενός διατηρημένου μηχανισμού που περιλαμβάνει μια βαθιά διαμορφωτική αλλαγή (όπως ανασκοπήθηκε στο Miranda and Lomas, 2006· Wang et al., 2008· και Ricagno et al., 2009).
Τι κάνει ο αναστολέας πρωτεάσης;
Οι αναστολείς πρωτεάσης, που συγκαταλέγονται μεταξύ των βασικών φαρμάκων που χρησιμοποιούνται για τη θεραπεία του HIV, δρουν δεσμεύοντας σε πρωτεολυτικά ένζυμα (πρωτεάσες). Αυτό το
μπλοκάρει την ικανότητά τους να λειτουργούν. Οι αναστολείς πρωτεάσης δεν θεραπεύουν τον HIV. Αλλά μπλοκάροντας τις πρωτεάσες, μπορούν να σταματήσουν τον HIV από την αναπαραγωγή του.
Τι είναι ο μηχανισμός πρωτεάσης σερίνης;
Οι πρωτεάσες σερίνης (ή οι ενδοπεπτιδάσες σερίνης) είναι ένζυμα που διασπούν τους πεπτιδικούς δεσμούς στις πρωτεΐνες, στις οποίες η σερίνη χρησιμεύει ως το πυρηνόφιλο αμινοξύ στη δραστική θέση (του ενζύμου). Βρίσκονται παντού και στους ευκαρυώτες και στους προκαρυώτες.
Πώς λειτουργούν πραγματικά οι πρωτεάσες σερίνης;
Υποστηρίζεται ότι οι πρωτεάσες σερίνης και άλλα ένζυμα λειτουργούν με το παρέχοντας ηλεκτροστατική συμπληρωματικότητα στις αλλαγές στην κατανομή φορτίου που συμβαίνουν κατά τη διάρκεια των αντιδράσεων που καταλύουν.
Είναι ανταγωνιστικοί οι αναστολείς πρωτεάσης σερίνης;
Η συντριπτική πλειοψηφία των αναστολέων πρωτεάσης είναι ανταγωνιστικοί αναστολείς. Παρά τους διαφορετικούς στόχους και τους διαφορετικούς μηχανισμούς αναστολής, οι περισσότεροι αναστολείς πρωτεάσης δεσμεύουν ένα κρίσιμο τμήμαο αναστολέας στην ενεργό θέση με τρόπο που μοιάζει με υπόστρωμα (Εικόνα 2).