Ο κύριος παράγοντας στον καταλυτικό μηχανισμό στις πρωτεάσες σερίνης είναι η καταλυτική τριάδα καταλυτική τριάδα Μια καταλυτική τριάδα είναι ένα σύνολο τριών συντονισμένων αμινοξέων που μπορεί να βρεθεί στο ενεργό θέση ορισμένων ενζύμων. Οι καταλυτικές τριάδες βρίσκονται πιο συχνά σε ένζυμα υδρολάσης και τρανσφεράσης (π.χ. πρωτεάσες, αμιδάσες, εστεράσες, ακυλάσες, λιπάσες και β-λακταμάσες). https://en.wikipedia.org › wiki › Catalytic_triad
Καταλυτική τριάδα - Wikipedia
. … Η σερίνη έχει μια ομάδα -ΟΗ που είναι σε θέση να δρα ως πυρηνόφιλο, προσβάλλοντας τον άνθρακα καρβονυλίου του σπασμένου πεπτιδικού δεσμού του υποστρώματος.
Πώς λειτουργούν οι αναστολείς πρωτεάσης σερίνης;
Οι αναστολείς πρωτεάσης σερίνης, ή σερπίνες, περιλαμβάνουν μια οικογένεια πρωτεϊνών που ανταγωνίζονται τη δραστηριότητα των πρωτεασών σερίνης. … Σε αυτόν τον μηχανισμό, η σερπίνη παρουσιάζει μια πεπτιδική αλληλουχία που μιμείται το υπόστρωμα-τον αντιδραστικό κεντρικό βρόχο-στην πρωτεάση της σερίνης-στόχου.
Τι ρόλο στον μηχανισμό αντίδρασης πρωτεάσης σερίνης παίζει το σύστημα αναμετάδοσης φορτίου;
Ο ρόλος του Asp102 στο καταλυτικό σύστημα αναμετάδοσης των πρωτεασών σερίνης μελετάται θεωρητικά με το υπολογίζοντας τα προφίλ ελεύθερης ενέργειας της απλής αντίδρασης μεταφοράς πρωτονίων από τη μεταλλαγμένη θρυψίνη Asn102 και την συντονισμένη διπλή αντίδραση μεταφοράς πρωτονίων (αποκαλούμενος μηχανισμός αναμετάδοσης φορτίου) της άγριου τύπου τρυψίνης.
Ποιο από τα παρακάτω είναι παράδειγμα πρωτεάσης σερίνης;
Χυμοθρυψίνη: >Χρησιμοποιείται ως παράδειγμα πρωτεάσης σερίνης επειδή η δομή και ο μηχανισμός της είναι καλά κατανοητοί.
Ποιοι είναι οι λόγοι που ονομάζονται πρωτεάσες σερίνης;
Ονομάζονται πρωτεάσες σερίνης για δύο λόγους:
- Υδρολύουν πρωτεΐνες.
- Έχουν ένα απαραίτητο υπόλειμμα Ser στο ενεργό σημείο που είναι κρίσιμο για την κατάλυση. Στην πραγματικότητα, αυτό το Ser είναι πολύ πιο αντιδραστικό από άλλες σερίνες στην πρωτεΐνη.
