Αντίθετα, οι περισσότερες ευκαρυωτικές λιγάσες DNA, μαζί με τα ένζυμα των αρχαίων και βακτηριοφάγων, εμπίπτουν στη δεύτερη υποοικογένεια. αυτά τα ένζυμα χρησιμοποιούν το ATP ως συμπαράγοντα.
Οι λιγάσες απαιτούν ATP;
Συνήθως χρησιμοποιούνται δύο λιγάσες DNA. … Η T4 λιγάση απαιτεί ATP ενώ η λιγάση E. coli απαιτεί NAD+ (Το δινουκλεοτίδιο νικοτιναμιδικής αδενίνης είναι ένα συνένζυμο που αποτελείται από 2 nt ενωμένα μέσω των φωσφορικών τους ομάδων). Και τα δύο καταλύουν τη σύνδεση μιας 5'-φωσφορικής και μιας ομάδας 3'-ΟΗ για να σχηματίσουν έναν φωσφοδιεστερικό δεσμό.
Γιατί οι λιγάσες χρειάζονται το ATP;
Τα δύο στάδια της αντίδρασης απολίνωσης DNA
Η ίδια η αντίδραση σύνδεσης DNA έχει δύο βασικά στάδια. Πρώτον τα άκρα του DNA πρέπει να συγκρουστούν κατά τύχη και να παραμείνουν μαζί για αρκετό καιρό ώστε η λιγάση να τα ενώσει. … Για να επιτραπεί στο ένζυμο να πραγματοποιήσει περαιτέρω αντιδράσεις, το AMP στη δραστική θέση του ενζύμου πρέπει να αναπληρωθεί με ATP.
Ποια είναι η λειτουργία των λιγασών;
Οι
λιγάσες DNA διαδραματίζουν ουσιαστικό ρόλο στη διατήρηση της γονιδιωματικής ακεραιότητας ενώνοντας θραύσματα στη ραχοκοκαλιά του φωσφοδιεστέρα που συμβαίνουν κατά την αντιγραφή και τον ανασυνδυασμό και ως συνέπεια της βλάβης του DNA και του επισκευή. Τρία ανθρώπινα γονίδια, τα LIG1, LIG3 και LIG4 κωδικοποιούν εξαρτώμενες από ATP λιγάσες DNA.
Τι είναι οι λιγάσες δρουν ενεργητικά ή παθητικά;
Η
DNA λιγάση είναι ενεργή κατά τη διάρκεια της διαδικασίας αντιγραφής, επιδιόρθωσης και ανασυνδυασμού του DNA. Εφαρμόζεται ευρέως στην επισκευή μονόκλωνωνσπάει στο διπλό DNA ζωντανών οργανισμών χρησιμοποιώντας τον συμπληρωματικό κλώνο της διπλής έλικας ως πρότυπο, ενώ ορισμένες μορφές μπορεί να επιδιορθώσουν ειδικά τις βλάβες διπλής έλικας.
