2024 Συγγραφέας: Elizabeth Oswald | [email protected]. Τελευταία τροποποίηση: 2024-01-13 00:05
Μοντέλα ομολογίας μπορούν επίσης να χρησιμοποιηθούν για τον εντοπισμό λεπτών διαφορών μεταξύ σχετικών πρωτεϊνών που δεν έχουν λυθεί όλες δομικά . Για παράδειγμα, η μέθοδος χρησιμοποιήθηκε για τον εντοπισμό θέσεων δέσμευσης κατιόντων στη Na+/K+ ATPάση και για την πρόταση υποθέσεων σχετικά με τη συγγένεια δέσμευσης διαφορετικών ΑΤΡασών.
Γιατί χρησιμοποιούνται τα μοντέλα ομολογίας;
Η μοντελοποίηση ομολογίας είναι μία από τις υπολογιστικές μεθόδους πρόβλεψης δομής που χρησιμοποιούνται για τον προσδιορισμό της τρισδιάστατης δομής πρωτεΐνης από την αλληλουχία αμινοξέων της. Θεωρείται ότι είναι η πιο ακριβής από τις μεθόδους πρόβλεψης υπολογιστικής δομής. Αποτελείται από πολλά βήματα που είναι απλά και εύκολα στην εφαρμογή.
Τι είναι η μοντελοποίηση ομολογίας και γιατί χρειάζεται;
Η μοντελοποίηση ομολογίας αποκτά την τρισδιάστατη δομή μιας πρωτεΐνης στόχου που βασίζεται στην ομοιότητα μεταξύ προτύπων και αλληλουχιών στόχου και αυτή η τεχνική αποδεικνύεται αποτελεσματική όταν πρόκειται για τη μελέτη πρωτεϊνών μεμβράνης που είναι δύσκολο να κρυσταλλωθούν όπως το GPCR καθώς παρέχει υψηλότερο βαθμό κατανόησης του …
Πώς κάνεις ένα μοντέλο ομολογίας;
υπάρχουν πολλά βήματα που εμπλέκονται στη μοντελοποίηση ομολογίας
- επιλογή προτύπου χρησιμοποιώντας την ακολουθία στόχου σας. Για το σκοπό αυτό μπορείτε να κάνετε αναζήτηση BLASTp έναντι όλων των διαθέσιμων πρωτεϊνικών δομών (PDB). …
- Στοίχιση προτύπου και αλληλουχίας στόχου. …
- Ποιότητα του μοντέλου σας. …
- Βελτίωσητου μοντέλου σας αναλόγως.
Τι κάνει ένα καλό μοντέλο ομολογίας;
Αν ορίσουμε ένα "υψηλά επιτυχημένο μοντέλο ομολογίας" ως ένα μοντέλο που έχει <=2 Å rmsd από την εμπειρική δομή, τότε το πρότυπο πρέπει να έχει >=60% ταυτότητα ακολουθίας με τον στόχο για επιτυχία ποσοστό >70%. Ακόμη και σε υψηλές ταυτότητες ακολουθίας (60%-95%), έως και ένα στα δέκα μοντέλα ομολογίας έχει rmsd >5 Å έναντι
Συνιστάται:
Πότε χρησιμοποιείται το reeked;
Παράδειγμα πρότασης με όρεξη Την φύτεψαν οι δαίμονες. Δεν ξέρω γιατί σε διάλεξαν, αλλά το έκαναν και είσαι αυτός που κυνήγησε. Μύριζε από δαίμονα, Κρις. Το ρούχο ήταν προφανώς αρκετά παλιό και τώρα που ήταν έξω από το δοχείο του, μύριζε υγρασία και βρωμιά.
Πού εμφανίζεται η σειριακή ομολογία;
Τα σπονδυλωτά έχουν τροποποιήσει τους σπονδύλους και τα πλευρά με πολλούς τρόπους. ο βασικός σπόνδυλος έχει επαναληφθεί και μεταβληθεί σε διαφορετικούς τύπους σπονδυλικής στήλης: ιερός, οσφυϊκός, θωρακικός και αυχενικός. Ωστόσο, ίσως ένα από τα καλύτερα παραδείγματα σειριακής ομολογίας μπορεί να βρεθεί στο το σχέδιο σώματος της κοινής καραβίδας.
Εννοείς ομολογία;
Η ομοιότητα μιας δομής ή λειτουργίας μερών διαφορετικής προέλευσης με βάση την καταγωγή τους από έναν κοινό εξελικτικό πρόγονο είναι ομολογία. Τι σημαίνει Logous; μια συνδυαστική φόρμα που σημαίνει "έχω αντιστοιχία ή σχέση"
Υποστηρίζει η μοριακή ομολογία την εξέλιξη;
Μοριακή βιολογία Όπως και οι δομικές ομολογίες, οι ομοιότητες μεταξύ βιολογικών μορίων μπορεί να αντικατοπτρίζουν την κοινή εξελικτική καταγωγή. Στο πιο βασικό επίπεδο, όλοι οι ζωντανοί οργανισμοί μοιράζονται: … Τα ίδια μοριακά δομικά στοιχεία, όπως τα αμινοξέα.
Πότε να χρησιμοποιείται π.χ. και πότε να χρησιμοποιείται π.χ
Δηλ. είναι μια συντομογραφία για τη φράση id est, που σημαίνει "δηλαδή." Δηλ. χρησιμοποιείται για να επαναδιατυπώσει κάτι που ειπώθηκε προηγουμένως προκειμένου να διευκρινιστεί η σημασία του. Π.χ. είναι συντομογραφία του exempli gratia, που σημαίνει "
