Πού εντοπίζονται θέσεις υπερευαισθησίας στο DNase I και τι υποδεικνύουν για τη φύση της χρωματίνης; Αυτές οι θέσεις βρίσκονται στις οι συνδέσεις εξονίου-ιντρονίου και υποδεικνύουν τη θέση διάσπασης του mRNA κατά τη διάρκεια του ματίσματος. Αυτές οι θέσεις βρίσκονται τυχαία σε όλο το γονιδίωμα και καθιστούν το DNA ευάλωτο στην αποικοδόμηση.
Τι είναι μια υπερευαίσθητη τοποθεσία DNase I και πώς επηρεάζει τη χρωματίνη;
Στη γενετική, οι υπερευαίσθητες θέσεις σε DNase I (DHS) είναι περιοχές της χρωματίνης που είναι ευαίσθητες στη διάσπαση από το ένζυμο DNase I. Σε αυτές τις συγκεκριμένες περιοχές του γονιδιώματος, η χρωματίνη έχει χάσει τη συμπυκνωμένη δομή της, εκθέτοντας το DNA και καθιστώντας το προσβάσιμο.
Τι προτείνει ένας υπερευαίσθητος ιστότοπος DNase;
Τα ενεργά ρυθμιστικά στοιχεία cis είναι υπερευαίσθητα στη διάσπαση από την ενδονουκλεάση DNase I. Τα μοτίβα εντός των υπερευαίσθητων θέσεων σε DNase I υποδεικνύουν πιθανή κατοχή παράγοντα trans-δράσης και, όταν συνδυάζονται με DNase I δεδομένα διάσπασης, μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την κατασκευή προσωρινών ρυθμιστικών δικτύων.
Τι είναι η δοκιμασία υπερευαισθησίας DNase;
Για περισσότερες από δύο δεκαετίες, η δοκιμασία υπερευαισθησίας DNase I (DHA) ήταν οργανικό για την ανακάλυψη ρυθμιστικών τομέων (11). Αυτή η μέθοδος χαρτογραφεί διακριτές θέσεις στο γονιδίωμα όπου η διαμόρφωση της χρωματίνης καθιστά το DNA της υπερευαίσθητο στη διάσπαση από την ενδονουκλεάση DNase I (12).
Τι είναι μια υπερευαίσθητη θέση στη νουκλεάση στη χρωματίνη;
ΜέσαΧρωματίνη, περιοχές απαλλαγμένες από νουκλεόσωμα, γνωστές ως υπερευαίσθητες θέσεις σε νουκλεάση, πιστεύεται ότι αντιπροσωπεύουν τα "ανοιχτά παράθυρα" που επιτρέπουν ενισχυμένη πρόσβαση των κρίσιμων μόνιμων αλληλουχιών DNA που δρουν cis σε παράγοντες trans-δράσης (βλ. Αναφ..
