Δεδομένου ότι η η υπερήχων μπορεί δυνητικά να αποικοδομήσει πρωτεΐνες και να μετουσιώσει πρωτεϊνικούς επιτόπους, στη συνέχεια αξιολογήσαμε την επίδραση της υπερήχων στην ακεραιότητα της πρωτεΐνης.
Μπορεί η υπερήχηση να βλάψει τις πρωτεΐνες;
Δημοφιλείς απαντήσεις (1)
Το τυπικό πρωτόκολλο υπερήχων αντίον δεν μπορεί να προκαλέσει κατακερματισμό πρωτεΐνης - η ενέργεια είναι πολύ χαμηλή. Δεν πρέπει να προκαλεί καν τη μετουσίωση του. Μπορεί να μετουσιωθεί όταν το κάνετε υπερήχους για πολύ καιρό και υπερθερμαίνετε το δείγμα. Εάν χρησιμοποιείτε χρωματογραφία νικελίου, άλλες ζώνες μπορεί να είναι απλώς ακαθαρσίες.
Μπορεί η υπερήχηση να σπάσει τους πεπτιδικούς δεσμούς;
Η υπερήχηση δεν μπορεί κανονικά να διασπάσει την πρωταρχική δομή μιας πρωτεΐνηςεπειδή αυτή η δομή (η αλληλουχία αμινοξέων) είναι κατασκευασμένη από ομοιοπολικούς δεσμούς που είναι πολλές φορές ισχυρότεροι από τους δεσμούς υδρογόνου και η υπερήχηση μπορεί παρέχει την ενέργεια που απαιτείται για να σπάσει αυτούς τους δεσμούς.
Η υπερήχηση σπάει την πυρηνική μεμβράνη;
Μια σύντομη υπερήχηση με χαμηλή ενέργεια μπορεί να διαταράξει την πλασματική μεμβράνη χωρίς να σπάσει πάρα πολλές μιτοχονδριακές ή πυρηνικές μεμβράνες που παράγουν διακριτικά μιτοχόνδρια.
Είναι απαραίτητη η υπερήχηση για την εκχύλιση πρωτεΐνης;
Η διαλυτοποίηση απορρυπαντικού (π.χ. SDS) που απαιτείται για την απομόνωση των πρωτεϊνών της μεμβράνης έχει ως αποτέλεσμα ένα προϊόν λύσης που μοιάζει με κόλλα κυρίως λόγω των νουκλεϊκών οξέων. Απαιτείται επομένως υπερήχηση σε τέτοιες περιπτώσεις για να διαταραχθούν αυτά τα νουκλεϊκά οξέα. Η υπερήχηση παράγει πολλή θερμότητα και δεν είναι καλή γιαπολλές πρωτεΐνες.
