Το
BLAST μπορεί να χρησιμοποιηθεί για διάφορους σκοπούς. Αυτά περιλαμβάνουν αναγνώριση ειδών, εντοπισμός τομέων, διαπίστωση φυλογένεσης, χαρτογράφηση DNA και σύγκριση. Με τη χρήση του BLAST, μπορείτε πιθανώς να αναγνωρίσετε σωστά ένα είδος ή να βρείτε ομόλογα είδη.
Γιατί χρησιμοποιείται το BLAST;
Το
BLAST είναι ένας αλγόριθμος υπολογιστή που είναι διαθέσιμος για χρήση στο διαδίκτυο στον ιστότοπο του Εθνικού Κέντρου Πληροφοριών Βιοτεχνολογίας (NCBI), καθώς και σε πολλούς άλλους ιστότοπους. Το BLAST μπορεί ταχέως να ευθυγραμμίσει και να συγκρίνει μια αλληλουχία DNA ερωτήματος με μια βάση δεδομένων αλληλουχιών, γεγονός που το καθιστά κρίσιμο εργαλείο στη συνεχιζόμενη γονιδιωματική έρευνα.
Τι είναι η τεχνική BLAST;
Η τεχνική BLAST είναι μια μέθοδος επίλυσης παραπόνων που αναπτύχθηκε από τον Albert Barneto . Το μνημονικό σημαίνει Πιστέψτε, Ακούστε, Απολογηθείτε, Ικανοποιήστε και Ευχαριστώ (Πίνακας 1). 6. Αυτό το άρθρο περιγράφει τη χρησιμότητά του στη φροντίδα ασθενών και ως εργαλείο κλινικής διδασκαλίας.
Πώς λειτουργεί το BLAST στο DNA;
Πώς λειτουργεί το BLAST; Το BLAST αναγνωρίζει ομόλογες αλληλουχίες χρησιμοποιώντας μια ευρετική μέθοδο που αρχικά βρίσκει σύντομες αντιστοιχίσεις μεταξύ δύο αλληλουχιών. Έτσι, η μέθοδος δεν λαμβάνει υπόψη ολόκληρο τον χώρο της ακολουθίας. Μετά την αρχική αντιστοίχιση, το BLAST επιχειρεί να ξεκινήσει τοπικές ευθυγραμμίσεις από αυτές τις αρχικές αντιστοιχίσεις.
Γιατί το BLAST είναι πιο γρήγορο από το Fasta;
Όσον αφορά την πολυπλοκότητα χρόνου εκτέλεσης αλγορίθμου, το BLAST είναι ταχύτερο από το FASTA με αναζήτηση μόνο των πιο σημαντικών μοτίβων στοακολουθίες. Η ευαισθησία (ή η ακρίβεια) του BLAST και του FASTA τείνει να είναι διαφορετική για τις αλληλουχίες νουκλεϊκών οξέων και πρωτεϊνών (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
