Οι πεπτιδικοί δεσμοί έχουν επίπεδη, trans, διαμόρφωση και υφίστανται πολύ μικρή περιστροφή ή περιστρέφονται γύρω από τον αμιδικό δεσμό που συνδέει το α-αμινο άζωτο ενός αμινοξέος με τον άνθρακα καρβονυλίου του επόμενου (Εικόνα 4-1).
Γιατί απαγορεύεται η εναλλαγή σχετικά με τον πεπτιδικό δεσμό;
Γιατί απαγορεύεται η εναλλαγή γύρω από τον πεπτιδικό δεσμό και ποιες είναι οι συνέπειες της έλλειψης περιστροφής; Ο πεπτιδικός δεσμός έχει μερικό χαρακτήρα διπλού δεσμού, ο οποίος αποτρέπει την περιστροφή. Αυτή η έλλειψη περιστροφής περιορίζει τις διαμορφώσεις της πεπτιδικής ραχοκοκαλιάς και περιορίζει πιθανές δομές.
Μπορούν οι πεπτιδικοί δεσμοί να λυγίσουν;
Δεδομένου ότι η ραχοκοκαλιά του πολυπεπτιδίου, που συγκρατείται από πεπτιδικούς δεσμούς, είναι ευέλικτη (εξαιτίας της "περιστροφής γύρω από όλους αυτούς τους δεσμούς"), η αλυσίδα μπορεί να λυγίσει, να στρίψει, και λυγίστε σε μια πολύ μεγάλη ποικιλία τρισδιάστατων σχημάτων.
Είναι οι πεπτιδικοί δεσμοί αναστρέψιμοι;
Αν και ο σχηματισμός πεπτιδικού δεσμού μπορεί να αντιστραφεί με την προσθήκη νερού (υδρόλυση), οι αμιδικοί δεσμοί είναι πολύ σταθεροί στο νερό σε ουδέτερο pH και η υδρόλυση των πεπτιδικών δεσμών στα κύτταρα ελέγχεται επίσης ενζυματικά.
Οι πεπτιδικοί δεσμοί έχουν κατευθυντικότητα;
Ακόμη κι αν η γεωμετρία της πεπτιδικής ομάδας είναι σταθερή, οι δεσμοί και στις δύο πλευρές των ανθράκων άλφα μπορούν να περιστρέφονται. Αυτό επιτρέπει ευελιξία στη ραχοκοκαλιά του πεπτιδίου. … Η αλληλουχία των αμινοξέων στην πρωτεΐνη έχει κατευθυντικότητα ήπροσανατολισμός που ορίζεται από τις λειτουργικές ομάδες στα άκρα της αλυσίδας.
